本发明涉及一种阻燃低熔点聚酯纤维及其制备方法，阻燃低熔点聚酯纤维为皮芯结构，皮层为低熔点聚酯，芯层为阻燃聚酯；低熔点聚酯由对苯二甲酸链段、间苯二甲酸链段、乙二醇链段、二甘醇链段以及含支链的十二碳二醇链段组成；阻燃聚酯由对苯二甲酸链段、乙二醇链段和阻燃剂2‑羟乙基苯基次磷酸链段组成。制备方法包括低熔点聚酯聚合和皮芯复合纺丝步骤，后纺采用牵伸工艺，经卷曲、切断和干燥获得阻燃低熔点聚酯纤维。本发明制得的阻燃低熔点聚酯纤维熔点低，阻燃效果好。