本发明涉及一种超短低熔点聚酯纤维及其制备方法，超短低熔点聚酯纤维为皮芯结构，皮层为低熔点聚酯，芯层为PET；低熔点聚酯由对苯二甲酸链段、间苯二甲酸链段、乙二醇链段、二甘醇链段、分子量调节剂链段以及含支链的十二碳二醇链段组成；分子量调节剂链段对应的分子量调节剂具体为一元酸系列或二元酸系列；制备方法包括低熔点聚酯聚合和皮芯复合纺丝步骤，后纺采用牵伸工艺，经上油、切断和干燥获得超短低熔点聚酯纤维。本发明制得超短低熔点聚酯纤维的起熔点有所降低且熔融速度加快，在相应温度下立刻熔融，熔融效果好。